Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d4aQ9D7V1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh2d4aQ9D7V1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh2d4aQ9D7V1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sh2d4aQ9D7V1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms