Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Echdc3Q9D7J9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Echdc3Q9D7J9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Echdc3Q9D7J9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Echdc3Q9D7J9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Echdc3Q9D7J9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Echdc3Q9D7J9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Echdc3Q9D7J9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Echdc3Q9D7J9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Echdc3Q9D7J9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Echdc3Q9D7J9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Echdc3Q9D7J9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Echdc3Q9D7J9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Echdc3Q9D7J9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Echdc3Q9D7J9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Echdc3Q9D7J9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Echdc3Q9D7J9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Echdc3Q9D7J9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Echdc3Q9D7J9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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