Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc39Q9D5Y1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc39Q9D5Y1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc39Q9D5Y1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc39Q9D5Y1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc39Q9D5Y1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms