Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5F6

4930447A16Rik, RIKEN cDNA 4930447A16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447A16RikQ9D5F6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930447A16RikQ9D5F6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930447A16RikQ9D5F6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930447A16RikQ9D5F6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930447A16RikQ9D5F6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930447A16RikQ9D5F6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930447A16RikQ9D5F6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930447A16RikQ9D5F6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930447A16RikQ9D5F6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930447A16RikQ9D5F6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930447A16RikQ9D5F6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930447A16RikQ9D5F6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930447A16RikQ9D5F6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930447A16RikQ9D5F6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930447A16RikQ9D5F6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930447A16RikQ9D5F6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930447A16RikQ9D5F6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930447A16RikQ9D5F6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms