Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rabl3Q9D4V7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rabl3Q9D4V7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabl3Q9D4V7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rabl3Q9D4V7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rabl3Q9D4V7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rabl3Q9D4V7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rabl3Q9D4V7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rabl3Q9D4V7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms