Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc83Q9D4V3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc83Q9D4V3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc83Q9D4V3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms