Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Clvs1Q9D4C9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clvs1Q9D4C9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clvs1Q9D4C9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms