Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vps33aQ9D2N9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vps33aQ9D2N9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms