Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc8Q9D2H8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc8Q9D2H8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Fndc8Q9D2H8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc8Q9D2H8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms