Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramef12Q9D2F1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramef12Q9D2F1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms