Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klhdc8bQ9D2D9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhdc8bQ9D2D9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhdc8bQ9D2D9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms