Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D131 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D131 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D131 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D131 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D131 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D131 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D131 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D131 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D131 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D131 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D131 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D131 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D131 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D131 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D131 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D131 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D131 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D131 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D131 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D131 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D131 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D131 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D131 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D131 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D131 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D131 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D131 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D131 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D131 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D131 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D131 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D131 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D131 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D131 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D131 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D131 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D131 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D131 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D131 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D131 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D131 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D131 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D131 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D131 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D131 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D131 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D131 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D131 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D131 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D131 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D131 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D131 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D131 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D131 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D131 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D131 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D131 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D131 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D131 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D131 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D131 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D131 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D131 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D131 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D131 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D131 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D131 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D131 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D131 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D131 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D131 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D131 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D131 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D131 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D131 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D131 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D131 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D131 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D131 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D131 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D131 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D131 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D131 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D131 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D131 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D131 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D131 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D131 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D131 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D131 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D131 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D131 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D131 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D131 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D131 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D131 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D131 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D131 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D131 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.7 ms