Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
Arv1Q9D0U9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Arv1Q9D0U9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,22■□□□□ 0,67
Arv1Q9D0U9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19,22■□□□□ 0,67
Arv1Q9D0U9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Arv1Q9D0U9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Arv1Q9D0U9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Arv1Q9D0U9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Arv1Q9D0U9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,21■□□□□ 0,67
Arv1Q9D0U9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Arv1Q9D0U9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Arv1Q9D0U9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,2■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,19■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19,19■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19,19■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19,18■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,16■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19,16■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19,15■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,66
Arv1Q9D0U9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,14■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19,13■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19,13■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,12■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19,12■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,11■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19,11■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19,1■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19,1■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19,1■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,1■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,09■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19,09■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Arv1Q9D0U9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,08■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19,07■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19,06■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,06■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19,06■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,06■□□□□ 0,64
Arv1Q9D0U9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,05■□□□□ 0,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,7 ms