Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B0

Srsf9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf9Q9D0B0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf9Q9D0B0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf9Q9D0B0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srsf9Q9D0B0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf9Q9D0B0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf9Q9D0B0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf9Q9D0B0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf9Q9D0B0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf9Q9D0B0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf9Q9D0B0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf9Q9D0B0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf9Q9D0B0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf9Q9D0B0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srsf9Q9D0B0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 531.5 ms