Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shisa9Q9CZN4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms