Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim13Q9CYB0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim13Q9CYB0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim13Q9CYB0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim13Q9CYB0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim13Q9CYB0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim13Q9CYB0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trim13Q9CYB0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim13Q9CYB0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim13Q9CYB0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms