Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PmpcbQ9CXT8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PmpcbQ9CXT8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PmpcbQ9CXT8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 292 ms