Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufaf1Q9CWX2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufaf1Q9CWX2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufaf1Q9CWX2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufaf1Q9CWX2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufaf1Q9CWX2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf1Q9CWX2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf1Q9CWX2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf1Q9CWX2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf1Q9CWX2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf1Q9CWX2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf1Q9CWX2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf1Q9CWX2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf1Q9CWX2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufaf1Q9CWX2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufaf1Q9CWX2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms