Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnot11Q9CWN7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot11Q9CWN7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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