Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx2Q9CWK8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx2Q9CWK8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx2Q9CWK8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.6 ms