Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubb2bQ9CWF2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb2bQ9CWF2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb2bQ9CWF2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubb2bQ9CWF2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubb2bQ9CWF2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubb2bQ9CWF2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubb2bQ9CWF2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubb2bQ9CWF2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubb2bQ9CWF2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubb2bQ9CWF2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubb2bQ9CWF2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubb2bQ9CWF2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms