Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930524J08RikQ9CUJ5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
4930524J08RikQ9CUJ5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms