Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pard3bQ9CSB4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pard3bQ9CSB4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pard3bQ9CSB4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms