Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CRC3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CRC3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CRC3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CRC3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CRC3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRC3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CRC3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRC3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CRC3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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