Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gkn1Q9CR36 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gkn1Q9CR36 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms