Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PsenenQ9CQR7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PsenenQ9CQR7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PsenenQ9CQR7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PsenenQ9CQR7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms