Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc2Q9CQP2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc2Q9CQP2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc2Q9CQP2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc2Q9CQP2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms