Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccer1Q9CQL2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccer1Q9CQL2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms