Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE2

Tmem223, Transmembrane protein 223, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem223Q9CQE2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem223Q9CQE2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem223Q9CQE2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem223Q9CQE2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.4 ms