Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc5Q9CQA1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc5Q9CQA1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms