Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nudcd2Q9CQ48 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd2Q9CQ48 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nudcd2Q9CQ48 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms