Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Med21Q9CQ39 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Med21Q9CQ39 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms