Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpd52l3Q9CQ14 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpd52l3Q9CQ14 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpd52l3Q9CQ14 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpd52l3Q9CQ14 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpd52l3Q9CQ14 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpd52l3Q9CQ14 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpd52l3Q9CQ14 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpd52l3Q9CQ14 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpd52l3Q9CQ14 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpd52l3Q9CQ14 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpd52l3Q9CQ14 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpd52l3Q9CQ14 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpd52l3Q9CQ14 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpd52l3Q9CQ14 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpd52l3Q9CQ14 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpd52l3Q9CQ14 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpd52l3Q9CQ14 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpd52l3Q9CQ14 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpd52l3Q9CQ14 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpd52l3Q9CQ14 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpd52l3Q9CQ14 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpd52l3Q9CQ14 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms