Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Chmp3Q9CQ10 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Chmp3Q9CQ10 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Chmp3Q9CQ10 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Chmp3Q9CQ10 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Chmp3Q9CQ10 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chmp3Q9CQ10 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Chmp3Q9CQ10 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chmp3Q9CQ10 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp3Q9CQ10 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp3Q9CQ10 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp3Q9CQ10 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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