Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trim26Q99PN3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim26Q99PN3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms