Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
Rad54l2Q99NG0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rad54l2Q99NG0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rad54l2Q99NG0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rad54l2Q99NG0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Rad54l2Q99NG0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rad54l2Q99NG0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rad54l2Q99NG0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rad54l2Q99NG0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rad54l2Q99NG0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rad54l2Q99NG0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rad54l2Q99NG0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rad54l2Q99NG0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rad54l2Q99NG0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rad54l2Q99NG0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rad54l2Q99NG0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Rad54l2Q99NG0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rad54l2Q99NG0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Rad54l2Q99NG0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rad54l2Q99NG0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.9 ms