Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atoh8Q99NA2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atoh8Q99NA2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atoh8Q99NA2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atoh8Q99NA2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atoh8Q99NA2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms