Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramel1Q99MW3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pramel1Q99MW3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms