Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE1

Rilpl2, RILP-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rilpl2Q99LE1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rilpl2Q99LE1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rilpl2Q99LE1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rilpl2Q99LE1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rilpl2Q99LE1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rilpl2Q99LE1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rilpl2Q99LE1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rilpl2Q99LE1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rilpl2Q99LE1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rilpl2Q99LE1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rilpl2Q99LE1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rilpl2Q99LE1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rilpl2Q99LE1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rilpl2Q99LE1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rilpl2Q99LE1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.7 ms