Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC9

Pex6, Peroxisome assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex6Q99LC9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pex6Q99LC9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pex6Q99LC9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pex6Q99LC9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms