Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds2Q99L43 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds2Q99L43 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms