Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn3Q99JH7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clstn3Q99JH7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clstn3Q99JH7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Clstn3Q99JH7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn3Q99JH7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn3Q99JH7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn3Q99JH7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn3Q99JH7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clstn3Q99JH7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn3Q99JH7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clstn3Q99JH7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn3Q99JH7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn3Q99JH7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn3Q99JH7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn3Q99JH7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clstn3Q99JH7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn3Q99JH7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms