Protein–RNA interactions for Protein: Q99J87

Dhx58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx58Q99J87 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx58Q99J87 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx58Q99J87 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dhx58Q99J87 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dhx58Q99J87 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dhx58Q99J87 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx58Q99J87 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx58Q99J87 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx58Q99J87 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx58Q99J87 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx58Q99J87 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx58Q99J87 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx58Q99J87 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dhx58Q99J87 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dhx58Q99J87 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dhx58Q99J87 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dhx58Q99J87 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dhx58Q99J87 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dhx58Q99J87 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms