Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nrbp1Q99J45 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nrbp1Q99J45 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nrbp1Q99J45 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nrbp1Q99J45 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nrbp1Q99J45 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nrbp1Q99J45 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms