Protein–RNA interactions for Protein: Q99104

Myo5a, Unconventional myosin-Va, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5aQ99104 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo5aQ99104 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo5aQ99104 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo5aQ99104 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo5aQ99104 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo5aQ99104 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo5aQ99104 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo5aQ99104 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo5aQ99104 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo5aQ99104 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myo5aQ99104 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myo5aQ99104 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo5aQ99104 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo5aQ99104 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Myo5aQ99104 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo5aQ99104 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo5aQ99104 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo5aQ99104 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo5aQ99104 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo5aQ99104 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo5aQ99104 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo5aQ99104 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo5aQ99104 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5aQ99104 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5aQ99104 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5aQ99104 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5aQ99104 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo5aQ99104 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms