Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn16Q925N4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn16Q925N4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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