Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtn4ip1Q924D0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtn4ip1Q924D0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtn4ip1Q924D0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtn4ip1Q924D0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtn4ip1Q924D0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtn4ip1Q924D0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtn4ip1Q924D0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtn4ip1Q924D0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtn4ip1Q924D0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtn4ip1Q924D0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtn4ip1Q924D0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms