Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim7Q923T7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim7Q923T7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim7Q923T7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim7Q923T7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms