Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim59Q922Y2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim59Q922Y2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim59Q922Y2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms