Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q9

Chid1, Chitinase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chid1Q922Q9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chid1Q922Q9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chid1Q922Q9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chid1Q922Q9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chid1Q922Q9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chid1Q922Q9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chid1Q922Q9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chid1Q922Q9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Chid1Q922Q9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Chid1Q922Q9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chid1Q922Q9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms